Theo quy hoạch đến năm 2030, tầm nhìn đến năm 2050, phát triển kết cấu hạ tầng đường thủy nội địa đồng bộ, từng bước hiện đại, nâng cao chất lượng dịch vụ; khối lượng vận chuyển hàng hóa đạt khoảng 715 triệu tấn và vận chuyển khoảng 397 triệu lượt hành khách.

Phấn đấu tổng chiều dài các tuyến khai thác đồng bộ theo cấp kỹ thuật đạt khoảng 5.000km; phát triển hệ thống cảng, bến thủy nội địa đáp ứng nhu cầu vận tải hàng hóa và hành khách trên các hành lang vận tải thủy. Quy hoạch 9 hành lang vận tải thủy; 55 tuyến vận tải chính trên 140 tuyến sông, tổng chiều dài khoảng 7.300km; 54 cụm cảng hàng hóa, tổng công suất khoảng 361 triệu tấn; 39 cụm cảng hành khách chính, tổng công suất hơn 53 triệu lượt khách.