Bên cạnh những kết quả đạt được, giải ngân vốn đầu tư công vẫn gặp những khó khăn, vướng mắc khách quan và chủ quan, trong đó nguyên nhân chủ quan là chủ yếu làm kéo dài thời gian hoàn thành nhiệm vụ chuẩn bị đầu tư, thực hiện đầu tư dự án chậm, dẫn đến việc phân bổ kế hoạch vốn còn hạn chế, giải ngân vốn đầu tư công chưa đáp ứng yêu cầu.

Trong đó, do ảnh hưởng dịch bệnh Covid-19 kéo dài đã tác động không nhỏ đến tiến độ hoàn thiện thủ tục đầu tư, triển khai thực hiện dự án dự án trong giai đoạn 2021-2022. Việc hình thành nhiều quy trình, thủ tục mới dẫn tới khó nắm vững và thực hiện thống nhất các quy định của Luật, nhiều cơ quan, địa phương vẫn còn lúng túng, mất nhiều thời gian để hoàn thiện thủ tục do hồ sơ dự án phải thông qua nhiều cấp, nhiều cơ quan.

Bên cạnh đó, thủ tục lập quy hoạch chi tiết xây dựng, đấu thấu mất nhiều thời gian; giá nguyên nhiên vật liệu xây dựng tăng, khan hiếm, thiếu nguyên vật liệu, đất đắp nền…công tác chỉ đạo, điều hành, tổ chức triển khai thực hiện kế hoạch của một số cơ quan, địa phương có lúc, có nơi chưa kịp thời, còn lúng túng, bị động, thiếu quyết liệt, hiệu quả chưa cao; vẫn còn một số dự án khó khăn trong giải phóng mặt bằng chưa được giải quyết kịp thời, dứt điểm.