Mục tiêu hướng tới của việc sáp nhập nhằm xây dựng một trường đại học trọng điểm của tỉnh Hải Dương, trở thành cơ sở giáo dục đại học đa ngành, đa lĩnh vực với trọng tâm phát triển các ngành sư phạm, kinh tế, khoa học, kỹ thuật thuộc lĩnh vực công nghiệp, nông nghiệp. Phấn đấu từ 5 - 10 năm sau sáp nhập, Trường Đại học Hải Dương sẽ là cơ sở giáo dục trọng điểm, có uy tín, chất lượng, đóng góp cho sự phát triển kinh tế xã hội của tỉnh Hải Dương. Bên cạnh đó, việc sáp nhập 2 trường còn góp phần tinh gọn đơn vị sự nghiệp công lập, sử dụng hiệu quả các nguồn lực đầu tư cho giáo dục. Đồng thời, tạo điều kiện để trường sau sáp nhập từng bước thực hiện quyền tự chủ, tự chịu trách nhiệm trong việc thực hiện nhiệm vụ, tổ chức bộ máy, nhân sự, tài chính. Dự kiến sau sáp nhập, Trường Đại học Hải Dương mới sẽ có 8 phòng chức năng, 11 khoa, 2 trung tâm và giữ nguyên các trường thực hành.